Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF2Q12947 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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