Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
BPTFQ12830 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.16□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
BPTFQ12830 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
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