Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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FOXQ1Q9C009 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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FOXQ1Q9C009 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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FOXQ1Q9C009 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXQ1Q9C009 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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