Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP53Q70EK8 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP53Q70EK8 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP53Q70EK8 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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USP53Q70EK8 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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USP53Q70EK8 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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USP53Q70EK8 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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USP53Q70EK8 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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