Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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