Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN21Q16825 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPN21Q16825 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms