Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FXNQ16595 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FXNQ16595 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FXNQ16595 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FXNQ16595 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FXNQ16595 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FXNQ16595 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FXNQ16595 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
FXNQ16595 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FXNQ16595 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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