Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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COL19A1Q14993 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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COL19A1Q14993 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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