Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ODF1Q14990 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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