Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PEX6Q13608 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms