Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BFSP2Q13515 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BFSP2Q13515 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BFSP2Q13515 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BFSP2Q13515 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BFSP2Q13515 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
BFSP2Q13515 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
BFSP2Q13515 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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