Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
MKRN3Q13064 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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