Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NFIAQ12857 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
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