Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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