Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRBP23467 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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