Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SOBPA7XYQ1 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SOBPA7XYQ1 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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