Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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FOXQ1Q9C009 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXQ1Q9C009 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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FOXQ1Q9C009 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
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FOXQ1Q9C009 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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FOXQ1Q9C009 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXQ1Q9C009 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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