Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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DTX3Q8N9I9 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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DTX3Q8N9I9 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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DTX3Q8N9I9 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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DTX3Q8N9I9 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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DTX3Q8N9I9 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DTX3Q8N9I9 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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