Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CASP12Q6UXS9 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.5 ms