Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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