Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPE65Q16518 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
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