Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
E2F4Q16254 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
E2F4Q16254 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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