Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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SEC23AQ15436 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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SEC23AQ15436 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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SEC23AQ15436 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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SEC23AQ15436 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SEC23AQ15436 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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