Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBM39Q14498 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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