Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCINQ13939 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCINQ13939 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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CCINQ13939 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCINQ13939 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCINQ13939 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCINQ13939 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCINQ13939 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCINQ13939 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCINQ13939 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCINQ13939 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCINQ13939 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCINQ13939 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCINQ13939 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCINQ13939 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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