Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
MKRN4PQ13434 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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