Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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