Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM28Q13263 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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