Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HOXD1Q9GZZ0 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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