Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
AP5B1Q2VPB7 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
AP5B1Q2VPB7 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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