Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PCOLCEQ15113 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms