Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CKAP5Q14008 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms