Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
CBFBQ13951 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CBFBQ13951 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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