Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ATP1A4Q13733 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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