Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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