Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LSAMPQ13449 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms