Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRIM28Q13263 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRIM28Q13263 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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