Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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SH3BP1Q9Y3L3 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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SH3BP1Q9Y3L3 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SH3BP1Q9Y3L3 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SH3BP1Q9Y3L3 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SH3BP1Q9Y3L3 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
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