Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HERC5Q9UII4 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC5Q9UII4 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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