Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
UHRF1Q96T88 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UHRF1Q96T88 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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