Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP53Q70EK8 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP53Q70EK8 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP53Q70EK8 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP53Q70EK8 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP53Q70EK8 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP53Q70EK8 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP53Q70EK8 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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USP53Q70EK8 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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USP53Q70EK8 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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USP53Q70EK8 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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USP53Q70EK8 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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USP53Q70EK8 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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