Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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RTN1Q16799 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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RTN1Q16799 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RTN1Q16799 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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RTN1Q16799 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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RTN1Q16799 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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RTN1Q16799 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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RTN1Q16799 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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RTN1Q16799 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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RTN1Q16799 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RTN1Q16799 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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