Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXD1Q16676 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXD1Q16676 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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