| RUNX2 | Q13950 | AC006504.6-201 | ENST00000590142 | 199 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL360085.1-201 | ENST00000604713 | 532 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ST7-AS1_1.1-201 | ENST00000611142 | 116 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Six3os1_7.1-201 | ENST00000621512 | 201 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011124.2-201 | ENST00000518739 | 3222 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLCO1B3-202 | ENST00000381545 | 2805 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCDC30-201 | ENST00000340612 | 2664 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.380-201 | ENST00000365663 | 111 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR597-201 | ENST00000384968 | 97 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA3.2-201 | ENST00000408221 | 125 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KRTAP25-1-201 | ENST00000416044 | 370 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAMDC2-AS1-203 | ENST00000420573 | 339 nt | TSL 3 BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IPO7P1-201 | ENST00000442031 | 636 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008852.1-201 | ENST00000510198 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025647.1-201 | ENST00000517879 | 253 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001363.1-201 | ENST00000544108 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC136932.1-201 | ENST00000574771 | 208 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01900-203 | ENST00000585185 | 393 nt | TSL 3 BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355297.3-201 | ENST00000604082 | 446 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009831.4-201 | ENST00000620744 | 325 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091932.3-201 | ENST00000624223 | 323 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3674-201 | ENST00000636576 | 68 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIER3-202 | ENST00000381199 | 5188 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| RUNX2 | Q13950 | XRCC4-205 | ENST00000511817 | 1636 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008555.8-201 | ENST00000623602 | 2168 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.101-201 | ENST00000363154 | 102 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.105-201 | ENST00000363182 | 111 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-626P-201 | ENST00000363354 | 107 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA16B-201 | ENST00000364674 | 135 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.570-201 | ENST00000384750 | 101 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008080.3-201 | ENST00000440074 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC003988.1-201 | ENST00000447198 | 578 nt | TSL 5 BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBL5P3-201 | ENST00000475112 | 231 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-397P-201 | ENST00000516226 | 104 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1046P-201 | ENST00000516538 | 107 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC131281.1-201 | ENST00000522984 | 164 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.15-201 | ENST00000611544 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.16-201 | ENST00000613119 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.12-201 | ENST00000613778 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.20-201 | ENST00000613956 | 192 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.9-201 | ENST00000615427 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.11-201 | ENST00000616345 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.2-201 | ENST00000616535 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.3-201 | ENST00000617785 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.19-201 | ENST00000618602 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-1-201 | ENST00000618664 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.6-201 | ENST00000619225 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.5-201 | ENST00000619465 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.10-201 | ENST00000620268 | 191 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC130454.1-201 | ENST00000622948 | 401 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HS1BP3-208 | ENST00000631166 | 78 nt | TSL 5 BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRKD3-201 | ENST00000234179 | 5900 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SKIL-202 | ENST00000413427 | 2702 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CALCRL-201 | ENST00000392370 | 5155 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP006437.1-201 | ENST00000641440 | 3685 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OSTN-201 | ENST00000339051 | 402 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.439-201 | ENST00000384119 | 94 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL117342.1-201 | ENST00000404861 | 406 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-121P-201 | ENST00000410525 | 99 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP192-201 | ENST00000411291 | 327 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P3-201 | ENST00000433603 | 273 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P5-201 | ENST00000436882 | 273 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108488.2-201 | ENST00000438485 | 421 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353689.1-201 | ENST00000438895 | 199 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073910.1-201 | ENST00000445047 | 438 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC074290.1-201 | ENST00000448883 | 135 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02540-201 | ENST00000455554 | 570 nt | TSL 3 BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP200-201 | ENST00000516360 | 103 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-897P-201 | ENST00000517135 | 105 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.720-201 | ENST00000517166 | 92 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-12P-201 | ENST00000517216 | 168 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007229.1-201 | ENST00000590455 | 412 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.772-201 | ENST00000606692 | 102 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DLX6-AS1_2.1-201 | ENST00000613701 | 207 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004467.1-201 | ENST00000615678 | 330 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006001.4-201 | ENST00000622243 | 395 nt | BASIC | 2.07 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCDH11Y-203 | ENST00000362095 | 4220 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.26-201 | ENST00000362539 | 101 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-23P-201 | ENST00000363283 | 107 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.143-201 | ENST00000363520 | 106 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.214-201 | ENST00000364201 | 112 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-937P-201 | ENST00000384325 | 106 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ50-201 | ENST00000390487 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P1-201 | ENST00000399532 | 476 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355497.1-201 | ENST00000406262 | 551 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR548F4-201 | ENST00000408515 | 105 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP425-201 | ENST00000410336 | 112 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-20P-201 | ENST00000410425 | 191 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1199P-201 | ENST00000411249 | 104 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELOCP20-201 | ENST00000422460 | 345 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL354733.1-201 | ENST00000458016 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004917.1-201 | ENST00000490856 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005176.2-201 | ENST00000596933 | 147 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353149.1-201 | ENST00000610667 | 244 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL159152.1-201 | ENST00000635019 | 2587 nt | BASIC | 2.06 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYLC2-204 | ENST00000612124 | 1817 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.145-201 | ENST00000363527 | 102 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.183-201 | ENST00000363882 | 113 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.210-201 | ENST00000364161 | 110 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.230-201 | ENST00000364348 | 109 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |