Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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