Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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SHROOM2Q13796 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.73□□□□□ -2.53
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SHROOM2Q13796 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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SHROOM2Q13796 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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SHROOM2Q13796 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
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SHROOM2Q13796 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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SHROOM2Q13796 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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SHROOM2Q13796 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
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SHROOM2Q13796 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHROOM2Q13796 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
SHROOM2Q13796 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
SHROOM2Q13796 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
SHROOM2Q13796 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
SHROOM2Q13796 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.54
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