Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
RUNX3Q13761 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms