Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBA3CQ13748 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBA3CQ13748 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.8 ms