Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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