Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATRQ13535 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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